En 2003, la Coupe Pearson a été officiellement ressuscitée, mais pas sous la forme d'un match hors-concours où le vainqueur remporte tout, comme c'était le cas auparavant. Les équipes devant désormais s'affronter deux fois par saison, une fois à domicile et une fois à l'extérieur, il a été décidé que la nouvelle version de la Coupe Pearson serait décernée au vainqueur des six matchs de la saison. Lors de la première série de trois rencontres disputée au Stade olympique, du 20 au 22 juin, Toronto remporte deux matches sur trois. Montréal lui rend la pareille moins d'une semaine plus tard en remportant deux des trois matchs au SkyDome (du 27 au 29 juin). La série étant à égalité, la Coupe Pearson n'est attribuée à aucune des deux équipes lors de cette résurrection.
L'année suivante, en 2004, le format de la Coupe Pearson était le même que l'année précédente. Lors de la première série au SkyDome, Toronto remporte deux matchs sur trois entre le 25 et le 27 juin. Du 2 au 4 juillet, la série finale de la Coupe Pearson a eu lieu, avec deux victoires sur trois pour Montréal. La série, qui aurait dû être un affrontement canadien à Montréal pendant le week-end de la fête du Canada, a été déplacée au stade Hiram Bithorn de San Juan, à Porto Rico. La MLB tentait alors d'accroître l'intérêt du baseball à Porto Rico, mais la série a été un échec. Les matchs de San Juan n'attirent en moyenne que 8 000 spectateurs chacun, ce qui envoie la Coupe Pearson dans la tombe sans tambour ni trompette. La série étant à nouveau à égalité (trois matchs chacun), la Coupe Pearson n'a pas été décernée en 2004, et c'est la dernière fois qu'elle a été jouée, devant 8 200 fans désintéressés, en sol étranger.
